代謝組學平臺對未知復雜樣品的代謝組分析、目標化合物定量分析、脂質組學、糖組學分析、脂肪酸（C2-C30）分析和膽汁酸分析等。代謝組描述的是指生物體內源性代謝物質的整體，可以分為非靶向代謝組和靶向代謝組。非靶代謝組一般是基于LC-MS技術對樣本中的代謝物同時進行定性和定量分析，與本地自建庫和商業標準品數據庫同時進行一級、二級信息的匹配來進行物質鑒定。LC-MS方法適合檢測大部分代謝物，該技術成熟穩定，是研究代謝變化的主流技術，適用于各種復雜生物樣本，一次檢測能提供整體全面的代謝組信息。LC-MS比GC-MS的適用范圍更廣，適合各種復雜生物樣本。