微生物基因組重測序

一站式解析變異與差異


微生物種類繁多,菌株的分化速度快,需要有一個經濟快速的方法,對大范圍內的海量菌株進行測序研究,了解菌株間的變異信息。 微生物基因組重測序應運而生,它是基于小片段文庫的高通量測序數據,通過與近緣參考基因組進行比對,從而進行變異檢測的方法。 可以檢測獲得菌株和參考基因組的SNP、InDel、SVCNV等變異信息,以精準快捷為特點,系統全面的檢測變異信息。同時還可進一步進行物種進化、種群特征、選擇壓力等研究。

應用方向


相比芯片檢測或者外顯子測序,基因組 DNA 重測序可以全面的挖掘基因序列差異和結構變異,在全基因組水平上掃描并檢測與生物體重要性狀相關的突變位點,具有重大的科研價值和產業價值。利用全基因組重測序有助于快速發現與細菌/真菌重要性狀相關的遺傳變異,如病原真菌的致病因子信息、食用/藥用真菌的功能基因。除此之外,在對大規模樣本的分析過程中,結合進化學研究,可以幫助獲取細菌/真菌進化史、傳播規律等信息。