16S、18S、ITS等擴增子測序（二代） 一步到位檢測環境微生物多樣性
擴增子測序是對特定長度的PCR產物或捕獲的片段進行測序，分析序列中的變異。
16S/18S/ITS等擴增子測序即通過提取環境樣品的DNA，選擇合適的通用引物擴增16S/18S/ITS的目標區域，
通過檢測目標區域的序列變異和豐度，以研究環境微生物多樣性及群落組成差異。
16S/18S rDNA為編碼原/真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。
ITS分為兩個區域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之間，ITS2位于5.8S和28S之間。
16S/18S/ITS等擴增子測序（三代）
一次分析多個高變區信息，還原真實微生物群落結構
全長擴增子（16S/18S/ITS）測序基于Pacbio長讀長測序平臺，以16S為例，可以一次性獲得9個高變區序列信息，獲得注釋到“種”的分類鑒定！不僅可以提高物種鑒定分辨率，還可以通過全長序列進行準確的物種注釋，從而更加真實地還原樣本中微生物的群落結構。
應用方向
細菌多樣性研究：16S全長
真菌多樣性研究：ITS全長
真核微生物多樣性研究：18S全長
功能基因研究：反硝化細菌nirS、固氮菌nifH等
樣本類型
土壤/污泥/沉積物/腐殖質
水體濾膜(孔徑 0.22-0.45μm/直徑 3-4cm)
拭子
瘤胃液/發酵液/組織液(離心有明顯沉淀)
糞便/腸道內容物
動物/人組織
血漿
鮮奶
應用方向
醫學領域：疾病與人體微生物間關系，如代謝類疾病、消化類疾病、自身免疫性疾病、腫瘤癌癥、神經類疾病及其他疾病等
環境領域：某一特定環境（霧霾、沙塵等污染環境，住宅、商場等生活環境）的微生物群落組成，有機肥發酵處理、污水治理、石油降解、水體及海洋等微生物群落分布和組成等
畜牧領域：腸道、瘤胃等微生物與動物繁殖、生長發育、營養健康、免疫和疾病治療等的互作關系
農業領域：根際微生物與植物互作、農業耕作/施肥處理與土壤微生物群落等
生物能源：特殊功能的菌株、工程菌的開發
特殊極端環境：極端環境條件下的微生物類群研究
我們的優勢
周期短, 性價比高：采用最新測序平臺，通量更高，速度更快，運行時間更短，周期最短可達10天
科學方案設計：從材料選取，建庫測序，到數據分析， 每一步都需要科學、縝密的設計，以保障高質量研究成果
常見問題
1.16S測序哪個區域比較合適？
諾禾致源提供的幾個測序區域來自文獻調研，但是目前并沒有研究表明哪個測序區域更好。有文章研究表明土壤樣本，16S V4區（515F-806R）比較適合做擴增子研究，可檢測的物種多樣性更豐富， 并且可重復性強（PNAS. 2013. 110(16): 6548-6553.）。
2.若關注環境中的真核微生物多樣性，ITS測序和18S測序哪個更好?
ITS測序主要是針對真菌多樣性的研究，注釋準確度高；18S測序針對的是真核微生物，注釋到的范圍廣，但是就真菌來說精確度相對較低；可根據研究目的合理選擇測序方案。
3.擴增子與宏基因組的區別？
擴增子主要分為16S、18S、ITS測序，關注環境樣本中的物種組成，該技術物美價廉，實用性高。宏基因組關注環境樣本中的物種組成、功能組成及代謝通路等信息，該技術深入挖掘環境樣本功能層面的信息。
4.樣本送到公司，什么時候可以拿到結果？
自樣本檢測合格之后開始計算周期，包括建庫、測序、數據分析、結題。擴增子周期共計20個自然日。
常見問題
1. 三代擴增子有什么優勢？
三代擴增子可以獲得更準確的物種注釋結果，一次實現多個高變區的擴增和測序，種水平注釋結果可信度更高。
2. 樣本送到公司，什么時候可以拿到結果？
三代擴增子可以獲得更準確的物種注釋結果，一次實現多個高變區的擴增和測序，種水平注釋結果可信度更高。自樣本檢測合格之后開始計算周期，包括建庫、測序、數據分析、結題。全長擴增子周期共計30個自然日。
